Ces derniers jours, il y a eu des nouvelles et du buzz sur une variante du SRAS-CoV-2 identifiée en France, B.1.640.2, avec plus de 40 mutations génétiques. Les spécialistes se sont efforcés d’expliquer que, pour l’instant, il n’y a aucune raison de s’alarmer. Il est à surveiller, comme pour les autres variantes du virus.
De quelle variante s’agit-il ?
Début décembre, l’Institut hospitalo-universitaire (IHU) de Marseille avait signalé sur Twitter avoir détecté une nouvelle variante chez des patients de la commune de Forcalquier, en région Provence-Alpes-Côte d’Azur, dans le sud de la France. « Il a été baptisé ‘IHU’ et présenté [na base de dados] Gisaid avec le nom B.1.640.2.
Plus tard, fin décembre, des chercheurs de l’institut ont mis à disposition un article sur cette variante. sur la plateforme medRxiv, pas encore examiné par d’autres scientifiques. Dans cet article, il est mentionné que le B.1.640.2 avait été détecté chez des patients de la ville de Forcalquier, dans la région Provence-Alpes-Côte d’Azur, dans le sud de la France. Le cas de la première patiente où elle avait été identifiée avait voyagé au Cameroun.
L’analyse des variantes a révélé qu’il avait plus de 40 mutations génétiques. Dans la protéine de pointe, 14 changements ont été observés, dont N501Y et E484K, qui sont présents dans les variantes préoccupantes. La protéine de pointe est responsable de l’entrée du virus dans nos cellules et les variantes préoccupantes ont différentes mutations dans cette zone – par exemple, Ómicron en a plus de 30.
Le même article indique également : « Ce modèle de génotype a conduit à la création d’une nouvelle lignée appelée B.1.640.2 [no início de Dezembro], qui est un groupe phylogénétique frère de l’ancienne lignée B.1.640, désormais désignée B.1.640.1. B.1.640 est une variante sous surveillance pour le Centre européen de prévention et de contrôle des maladies (ECDC). Au site de l’ECDC, la première détection du variant a eu lieu en septembre 2021 au Congo. Dans les bases de données publiques, il existe plus de 300 séquences de cette variante sous surveillance sœur de B.1.640.2. Ces séquences ont été collectées en France, en Allemagne, en Italie, au Royaume-Uni et au Congo.
Ce que disent les experts
En raison du nombre de mutations et du partage de certaines d’entre elles avec d’autres variantes préoccupantes, B.1.640.2 a généré du buzz et de la panique sur les réseaux sociaux, tout en faisant l’objet de nouvelles.
Des experts ont dévoilé des explications. Vinod Scaria, scientifique à l’Institut de génomique et de biologie intégrative (à New Delhi) qui a étudié le génome du SRAS-CoV-2, a noté dans un message Twitter que B.1.640.1 (la sœur de B.1.640.2 ) fait déjà l’objet d’un suivi par l’Organisation mondiale de la santé depuis novembre.
Exactement à propos de B.1.640.2, il précise que, « bien qu’il soit antérieur à Ómicron, ses séquences [genéticas] n’ont pas augmenté rapidement [nas bases de dados]”. Le scientifique dit qu’on ne sait pas si l’augmentation des cas dans le sud de la France y est associée. Donc pour l’instant, il conclut : « Compte tenu des preuves disponibles, il n’y a pas de quoi paniquer ou s’inquiéter trop à ce stade. » Malgré tout, il souligne que « c’est quelque chose qui devrait être surveillé dans les semaines à venir ».
Tom Peacock, un scientifique de l’Imperial College de Londres qui a suivi l’évolution du virus, note également que B.1.640.2 est antérieur à Ómicron. « Pendant tout ce temps, il y a exactement [cerca de] 20 suites contre plus de 120 000 d’Ómicron en moins de temps », a-t-il écrit sur Twitter. « Certainement, à ce stade, il n’y a pas lieu de s’inquiéter. »
Sur le même réseau social, Tulio de Oliveira a renforcé : « S’il vous plaît, ne paniquez pas. » Le coordinateur du consortium Genomic Surveillance Network en Afrique du Sud et l’un des responsables de l’identification initiale d’Ómicron souligne que B.1.640.1 et B.1.640.2 n’ont rivalisé avec Delta nulle part.
François Balloux est même catégorique et indique que le B.1.640.2 n’explique pas l’augmentation des cas dans le sud de la France et qu’il n’a pas entraîné des centaines d’hospitalisations en réanimation dans cette partie du pays. « Détendez-vous pour l’instant », demande le chercheur de l’University College London.
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